Catovirus
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„Catovirus“ (CatV) ist eine vorgeschlagene Gattung von Riesenviren im Phylum Nucleocytoviricota (früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV) aus der Familie Mimiviridae,[3][4] Unterfamilie Klosneuvirinae,[5][1] mit nur einer bekannten Spezies, „Catovirus CTV1“.[6]
„Catovirus CTV1“ wurde bei der Analyse von Metagenomproben aus Bodensedimenten von Ablagerungen in der Kläranlage in Klosterneuburg nahe bei Wien, Österreich, gefunden. Zusammen mit „Catovirus CTV1“ wurden dort von Schulz et al. 2017 drei weitere Viren identifiziert, „Hokovirus HKV1“, „Indivirus ILV1“ und „Klosneuvirus KNV1“; der letztere Gattungsname ist Namensgeben für die Unterfamilie Klosneuvirinae, zu der noch weitere spätere Zugänge gehören.[7][5]
Genom Bearbeiten
„Catovirus CTV1“ hat wie alle diese Riesenviren ein Genom aus einer doppelsträngigen DNA (dsDNA). „Catovirus CTV1“ hat ein großes Genom von 1.532.259 Basenpaaren (bp) und kodiert vorhergesagt 1.427 Proteine bei 1.176 Genfamilien.[8] Dies ist das zweitgrößte Genom unter den genannten Klosneuviren nach „Klosneuvirus KNV1“ (1,57 Millionen Basenpaare, 1.272 Genfamilien). Der GC-Gehalt beträgt 26,4 %.[7]
Wirte Bearbeiten
Die Metagenomanalyse der ribosomalen 18S-rRNA zeigte, dass ihre Wirte einfachen Cercozoa (zumindest) nahestehen.[7]
Systematik Bearbeiten
Mit Stand 6. Mai 2023 ist die Gattung „Catovirus“ noch nicht vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt (Master Species List #38).[1] Das National Center for Biotechnology Information (NCBI) sieht die Gattung „Catovirus“ mit der Spezies „Catovirus CTV1“ in der Familie Mimiviridae,[3] nach Aylward et al. (2021) gehört sie zu deren Unterfamilie Klosneuvirinae (Klosneuviren).[5] Die Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) kennt neben „Catovirus CTV1“ noch eine weitere Spezies „Catovirus sp. 'naegleriensis'“.[3]
Phylogenien der Klosneuviren, die die Gattung „Catovirus“ bzw. die Spezies „Catovirus CTV1“ einschließen, finden sich beispielsweise bei Disa Bäckström et al. (2019), Fig. 3,[9] bei Aylward et al. (2021),[5] oder unter Klosneuvirinae §Systematik: Kladogramm.
Weblinks Bearbeiten
- Mitch Leslie: Giant viruses found in Austrian sewage fuel debate over potential fourth domain of life. In: Science, 5. April 2017; doi:10.1126/science.aal1005 (englisch).
- Fund im Abwasser – Forscher entdecken vier neue Riesenviren. Spiegel Online, 7. April 2017
- Alexandra Zinoviev, Kazushige Kuroha, Tatyana V. Pestova, Christopher U. T. Hellen: Two classes of EF1-family translational GTPases encoded by giant viruses. In: Nucleic Acids Research, Juni 2019, 47(11), S. 5761–5776; researchgate.net – doi:10.1093/nar/gkz296, PMC 6582330 (freier Volltext), PMID 31216040 (Hirudovirus, Catovirus und Moumouvirus)
- Christoph M. Deeg, Cheryl-Emiliane T. Chow, Curtis A. Suttle: The kinetoplastid-infecting Bodo saltans virus (BsV), a window into the most abundant giant viruses in the sea. In: eLife, 6. November 2017; doi:10.7554/elife.33014, bioRxiv: 10.1101/214536v1 (Preprint-Volltext)
- Yanze Li, Pascal Hingamp, Hiroyasu Watai, Hisashi Endo, Takashi Yoshida, Hiroyuki Ogata: Degenerate PCR Primers to Reveal the Diversity of Giant Viruses in Coastal Waters. In: Viruses, 10(9), September 2018, S. 496; doi:10.3390/v10090496
Einzelnachweise Bearbeiten
- ↑ a b c ICTV: Master Species Lists § ICTV Master Species List 2022 MSL38 v1 (xlsx), 8. April 2023.
- ↑ a b c d e ICTV Master Species List 2019.v1. ICTV, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
- ↑ a b c Catovirus (genus). NCBI (genus); abgerufen am 2. August 2019.
- ↑ Taxonomy – Catovirus (GENUS). Uniprot
- ↑ a b c d Frank O. Aylward, Jônatas S. Abrahão, Corina P. D. Brussaard C, Matthias G. Fischer, Mohammad Moniruzzaman, Hiroyuki Ogata, Curtis A. Suttle: Create 3 new families, 3 subfamilies, 13 genera, and 20 new species within the order Imitervirales (phylum Nucleocytoviricota) and rename two existing species (zip:docx). Vorschlag 2022.004F an das ICTV vom Oktober 2021.
- ↑ Catovirus CTV1 (species). NCBI; abgerufen am 20. August 2019
- ↑ a b c Frederik Schulz, Natalya Yutin, Natalia N. Ivanova, Davi R. Ortega, Tae Kwon Lee, Julia Vierheilig, Holger Daims, Matthias Horn, Michael Wagner: Giant viruses with an expanded complement of translation system components. In: Science. 356. Jahrgang, Nr. 6333, 7. April 2017, ISSN 0036-8075, S. 82–85, doi:10.1126/science.aal4657 (englisch, sciencemag.org).
- ↑ David M. Needham, Susumu Yoshizawa, Toshiaki Hosaka, Camille Poirier, Chang Jae Choi, Elisabeth Hehenberger, Nicholas A. T. Irwin, Susanne Wilken, Cheuk-Man Yung, Charles Bachy, Rika Kurihara, Yu Nakajima, Keiichi Kojima, Tomomi Kimura-Someya, Guy Leonard, Rex R. Malmstrom, Daniel R. Mende, Daniel K. Olson, Yuki Sudo, Sebastian Sudek, Thomas A. Richards, Edward F. DeLong, Patrick J. Keeling, Alyson E. Santoro, Mikako Shirouzu, Wataru Iwasaki, Alexandra Z. Worden: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators. In: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, inklusive Supplement 1 (xlsx).
- ↑ Disa Bäckström, Natalya Yutin, Steffen L. Jørgensen, Jennah Dharamshi, Felix Homa, Katarzyna Zaremba-Niedwiedzka, Anja Spang, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Thijs J. G. Ettema: Virus Genomes from Deep Sea Sediments Expand the Ocean Megavirome and Support Independent Origins of Viral Gigantism. In: mBio, Band 10 Nr. 2 2019; doi:10.1128/mBio.02497-18.