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Kyanoviridae

Kyanoviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes), die Cyanobakterien infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen, genauer Cyanophagen, genannt). Die Familie wurde im März/April 2022 vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) eingerichtet.[1]

Kyanoviridae

EM-Aufnahmen von Virionen der Pro­chloro­coccus-Cyano­phagen P-SSM2 (Gat­tung Salacisa­virus; oben) und P-SSM4 (Gat­tung Ronodor­virus; unten)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria
Reich: Heunggongvirae
Phylum: Uroviricota
Klasse: Caudoviricetes
Ordnung: incertae sedis
Familie: Kyanoviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Myoviren)
Wissenschaftlicher Name
Kyanoviridae
Links
NCBI Taxonomy: 2946160
ICTV Taxon History: 202213665

Forschungsgeschichte Bearbeiten

Diese Familie wurde vom ICTV eingerichtet, um alle T4-ähnlichen Cyanophagen zusammenzufassen. Die T4-ähnlichen Phagen, die dagegen histotrophe Bakterien[A. 1] infizieren, wurden stattdessen in der Familie Straboviridae zusammengefasst. Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den seinerzeit neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae.[2]

Etymologie Bearbeiten

Der Name der Familie Kyanoviridae leitet sich ab von ihren Wirten, den Cyanobakterien (altgriechisch κύανος kyanos, deutsch ‚blau‘, ‚cyan‘): versehen mit dem Suffix ‚-viridae‘ für Virusfamilien.[1][2]

Systematik Bearbeiten

Innere Systematik der Familie Kyanoviridae (Stand: 5. November 2023):[1][2]

Familie Kyanoviridae (54 Gattungen)[3]

  • Gattung: Acionnavirus
    • Spezies Synechococcus-Vvirus SMbCM100 (wiss. Acionnavirus monteraybay), mit
      • Synechococcus-Phage ACG-2014a
      • Synechococcus-Phage S-MbCM100
  • Gattung: Ahtivirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SShM2 (wiss. Ahtivirus sagseatwo), mit
      • Cyanophage S-RIM14
      • Cyanophage S-SSM2
      • Synechococcus-Phage S-ShM2
  • Gattung: Alisovirus
    • Spezies Alisovirus socal22, mit
      • Synechococcus-Phage S-CAM22
  • Gattung: Anaposvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SCAM1 (wioss. Anaposvirus socalone), mit
      • Synechococcus-Phage S-CAM1
  • Gattung: Atlauavirus
    • Spezies Synechococcus-Virus ACG2014f (wiss. Atlauavirus acg2014f)
    • Spezies Synechococcus-Virus ACG2014fSyn7803US26 (wiss. Atlauavirus caeruleum)
    • Spezies Synechococcus-Virus AC2014fSyn7803C8 (wiss. Atlauavirus tusconc8)
  • Gattung: Bellamyvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus Bellamy (wiss. Bellamyvirus bellamy)
  • Gattung: Bristolvirus
    • Spezies Bristolvirus rhodeisland, mit
      • Cyanophage S-RIM32
  • Gattung: Brizovirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus Syn33 (wiss. Brizovirus syn33)
  • Gattung: Chalconvirus
  • Gattung: Charybdisvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SCAM3 (wiss. Charybdisvirus scam3)
  • Gattung: Cymopoleiavirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SWAM2 (wiss. Cymopoleiavirus swam2)
  • Gattung: Emcearvirus
    • Spezies Emcearvirus gerard, mit
      • Cyanophage P-RSM1
  • Gattung: Galenevirus
  • Gattung: Gibbetvirus
    • Spezies Gibbetvirus rsm4, mit
      • Synechococcus-Phage S-RSM4
  • Gattung: Glaucusvirus
    • Spezies Glaucusvirus ssm5, mit
      • Synechococcus-Phage S-SSM5
  • Gattung: Greenvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SSM4 (wiss. Greenvirus ssm4),[4] mit
      • Synechococcus-Phage S-SSM4
    • Spezies „Cyanophage S-SSM6b“
  • Gattung: Haifavirus
    • Spezies Haifavirus tim68, mit
      • Prochlorococcus-Phage P-TIM68
  • Gattung: Huanghaivirus[5]
    • Spezies Huanghaivirus snothree, mit
      • Synechococcus-Phage S-N03
  • Gattung: Kanaloavirus
  • Gattung: Leucotheavirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SP4 (wiss. Leucotheavirus sp4)
    • Spezies Synechococcus-Virus Syn30 (wiss. Leucotheavirus syn30)
  • Gattung: Libanvirus
  • Gattung: Lipsvirus
    • Spezies Lipsvirus ssm7, mit
      • Synechococcus-Phage S-SSM7
  • Gattung: Lowelvirus
  • Gattung: Macariavirus
  • Gattung: Makaravirus
  • Gattung: Makelovirus
  • Gattung: Mazuvirus
  • Gattung: Namakavirus
  • Gattung: Neptunevirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIM8 (wiss. Neptunevirus srim18, früher Synechococcus virus SRIM8)
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIM50 (wiss. Neptunevirus srim50, früher Synechococcus virus SRIM50)
  • Gattung: Nereusvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus ACG2014bSyn7803C61 (wiss. Nereusvirus tusconc61, früher Synechococcus virus ACG2014bSyn7803C61)
    • Spezies Synechococcus-Virus ACG2014bSyn9311C4 (wiss. Nereusvirus tusconc4, früher Synechococcus virus ACG2014bSyn9311C4)
  • Gattung: Neritesvirus
  • Gattung: Nerrivikvirus
    • Spezies Nerrivikvirus srim2, mit
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIM2 (wiss. Nerrivikvirus srim2, früher Synechococcus virus SRIM2)
  • Gattung: Nilusvirus
    • Spezies Nilusvirus ssm2, mit
      • Synechococcus-Phage S-SM2
 
TEM-Aufnahme eines Virions von Synechococcus-Virus SPM2, Gattung Nodensvirus
  • Gattung: Nodensvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SPM2 (wiss. Nodensvirus spm2), mit
      • Synechococcus-Phage S-PM2 alias Bacteriophage S-PM (Referenzstamm)[6][7]
  • Gattung: Ormenosvirus
    • Spezies Ormenosvirus syn9, mit
      • Synechococcus-Phage syn9 (alias Bacteriophage Syn9 oder Cyanophage Syn9)[8][9]
    • Spezies „Cyanophage Syn10“
  • Gattung: Palaemonvirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus PSSM7 (wiss. Palaemonvirus pssm7)
  • Gattung: Pontusvirus
  • Gattung: Potamoivirus
  • Gattung: Ronodorvirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus PSSM4 (wiss. Ronodorvirus ssm4),[10][7] mit
      • Cyanophage P-RSM3
      • Cyanophage P-SS1
      • Prochlorococcus-Phage P-SSM4 (alias Cyanophage P-SSM4, Prochlorococcus-Cyanophage P-SSM4)
 
Wenn der Phage P-SSM2 Fd (rosa) das Cyanobakterium Prochlorococcus marinus infiziert, produziert er ein Ferredoxin-Protein, das sich in die bestehende elektrische Struktur des Bakteriums einhakt und seinen Stoffwechsel verändert.[11][12][13]
  • Gattung: Salacisavirus
  • Gattung: Scyllavirus
  • Gattung: Sedonavirus
  • Gattung: Serangoonvirus
  • Gattung: Shandvirus
  • Gattung: Shenzhenivirus
  • Gattung: Sokavirus
  • Gattung: Tamkungvirus
  • Gattung: Tefnutvirus
  • Gattung: Thaumasvirus
  • Gattung: Thetisvirus (wohl zu unterscheiden von der Gattung Thetysvirus der Unterfamilie Mesomimiviridae (Mimiviridae))
    • Spezies Synechococcus-Virus SSM1 (wiss. Thetisvirus ssm1), mit
      • Synechococcus-Phage S-SM1 alias Cyanophage S-SM1[19][15][16]
  • Gattung: Vellamovirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIM44 (wiss. Vellamovirus rhodeisland44), mit
      • Cyanophage S-RIM44
    • Spezies Prochlorococcus-Virus Syn1 (wiss. Vellamovirus syn1), mit
      • Prochlorococcus-Phage Syn1
  • Gattung: Yellowseavirus[5]
    • Spezies Yellowseavirus thirtyeight, mit
      • Synechococcus-Phage S-H38
  • Gattung: Yushanluvirus[5]
    • Spezies Yushanluvirus satich, mit
      • Synechococcus-Phage S-H9-2
  • Gattung: Zhoulongquanvirus[5]
    • Spezies Zhoulongquanvirus esscess, mit
      • Synechococcus-Phage S-SCSM1

Wirtsspektrum Bearbeiten

Die Wirte der Kyanoviridae sind Cyanobakterien (Blaugrünbakterien, „Blaualgen“). Dazu gehören Vertreter der Ordnungen Prochlorales[20] (Gattung Prochlorococcus) und Synechococcales[21] (Gattung Synechococcus).[A. 2][22]

Anmerkungen Bearbeiten

  1. ↑ Unter histotrophen (oder histiotrophen) Bakterien werden solche verstanden, die im Gewebe (insbes. von Tieren wie den Landwirbeltieren) leben und sich dort auf üblicherweise deren Kosten (parasitisch) ernähren, vgl. Histiotrophe.
  2. ↑ siehe § Systematik.

Weblinks und Literatur Bearbeiten

  • Martha R. J. Clokie, Andrew D. Millard, Nicholas Harold Mann: T4 genes in the marine ecosystem: studies of the T4-like cyanophages and their role in marine ecology. In: Virology Journal, Band 7, Nr. 291, 28. Oktober 2010; doi:10.1186/1743-422X-7-291, ResearchGate (englisch).

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ a b c ICTV: Taxon Details: Family: Kyanoviridae.
  2. ↑ a b c Andrew Millard, Richard Puxty, Dan White, Lucy Gannon, Christian Harrison, Ryan Cook, Evelien M. Adriaenssens, Dann Turner: Create two new families (Kyanoviridae and Straboviridae) (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.082B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
  3. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  4. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Greenvirus ssm4 (species).
  5. ↑ a b c d Andrew Millard, Richard Puxty, M. Nicholas: Creation of seven new genera within the family Kyanoviridae (Caudoviricetes) Vorschlag 2022.043B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
  6. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus phage S-PM2 (species). NCBI
  7. ↑ a b c John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned? In: Curr. Op. in Biotechnology, Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307; doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext) (englisch); siehe insbes. Fig. 3 (Genomkarte).
  8. ↑ Synechococcus phage syn9 (species). NCBI
  9. ↑ Cyanophage Syn9 (species). NCBI
  10. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Ronodorvirus ssm4 (species), equivalent: Prochlorococcus virus PSSM4.
  11. ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: EurekAlert! vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
  12. ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: ScienceDaily vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
  13. ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: National Science Foundation (NSF) vom 29. Mai 2020.
  14. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Prochlorococcus virus PSSM2 (species).
  15. ↑ a b Denise Brehm: Viruses Use Bacteria for Reproduction. SciTechDaily, 26. Januar 2012
  16. ↑ a b Qinglu Zeng, Sallie W. Chisholm: Marine Viruses Exploit Their Host’s Two-Component Regulatory System in Response to Resource Limitation. In: Curr Biol, Band 22, Nr. 2, CellPress vom 24. Januar 2012, S. 124–128; doi:10.1016/j.cub.2011.11.055, PDF (englisch), Supplement 1 (PDF; 329 kB)
  17. ↑ Ian J. Campbell, Jose Luis Olmos Jr., Weijun Xu, Dimithree Kahanda, Joshua T. Atkinson, Othneil Noble Sparks, Mitchell D. Miller, George N. Phillips Jr., George N. Bennett, Jonathan J. Silberg: ​Prochlorococcus phage ferredoxin: Structural characterization and electron transfer to cyanobacterial sulfite reductases – Phage Fd characterization and host SIR interactions. In: J. Biol. Chem., ASBMB Publications, 19. Mai 2020; doi:10.1074/jbc.RA120.013501 (englisch).
  18. ↑ Beneath the Ocean’s Surface, a Virus Is Hijacking the Most Abundant Organism on Earth. Auf: SciTechDaily vom 6. Juni 2020, Quelle: Rice University.
  19. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus virus S-SM1 (species).
  20. ↑ LPSN: Order Prochlorales (ex Lewin 1977) Florenzano et al. 1986.
  21. ↑ LPSN: Order "Synechococcales" Hoffmann et al. 2005.
  22. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Kyanoviridae, Details: Kyanoviridae (family).
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