MIAME

MIAME (englisch Minimum Information About a Microarray Experiment ‚minimale Information über ein Microarray-Experiment‘) ist ein Qualitätsstandard für Microarrays.^[1]

Eigenschaften Bearbeiten

MIAME wurde 2001 von der Functional Genomics Data Society (FGED) entwickelt.^[2] Durch MIAME wird der Umfang notwendiger Informationen für die Reproduzierbarkeit von Microarray-Experimenten definiert.^[3] Das verwendete Ausgabeformat ist nicht definiert. Es existieren verschiedene Programme zur Darstellung und Bearbeitung von MIAME-Daten, z. B. Annotare, MAGE-TAB, KUTE-BASE, MicroGen, MIAMExpress, Gene Traffic, Ipsogen Cancer Profiler, BASE, GeneData Expressionist, Partisan Array LIMS, LIMaS, Gene Director, GeneSpring and GeNet, MCHIPS, maxd, GenoWiz, RAD, GenePix, TeraGenomics, almaZen, GeneSifter, SeqExpress, MIAME Spice, ArrayHub, Feature Extraction, TM4, SAS Microarray, GenStat, GeneMaths XT und Tab2MAGE. Eine Datenbank für MIAME-Daten ist der Gene Expression Omnibus. Manche andere Proteomik-Methoden sind nach MIAPE-Standards definiert.

Weblinks Bearbeiten

Functional Genomics Data Society (FGED) Homepage. Abgerufen am 25. Juni 2014.

Einzelnachweise Bearbeiten

↑ A. Brazma: Minimum Information About a Microarray Experiment (MIAME)–successes, failures, challenges. In: TheScientificWorldJournal. Band 9, 2009, S. 420–423, ISSN 1537-744X. doi:10.1100/tsw.2009.57. PMID 19484163.
↑ A. Brazma, P. Hingamp, J. Quackenbush, G. Sherlock, P. Spellman, C. Stoeckert, J. Aach, W. Ansorge, C. A. Ball, H. C. Causton, T. Gaasterland, P. Glenisson, F. C. Holstege, I. F. Kim, V. Markowitz, J. C. Matese, H. Parkinson, A. Robinson, U. Sarkans, S. Schulze-Kremer, J. Stewart, R. Taylor, J. Vilo, M. Vingron: Minimum information about a microarray experiment (MIAME)-toward standards for microarray data. In: Nature genetics. Band 29, Nummer 4, Dezember 2001, S. 365–371, ISSN 1061-4036. doi:10.1038/ng1201-365. PMID 11726920.
↑ S. Oliver: On the MIAME Standards and Central Repositories of Microarray Data. In: Comparative and functional genomics. Band 4, Nummer 1, 2003, S. 1, ISSN 1531-6912. doi:10.1002/cfg.238. PMID 18629115. PMC 2447402 (freier Volltext).

[1] A. Brazma: Minimum Information About a Microarray Experiment (MIAME)–successes, failures, challenges. In: TheScientificWorldJournal. Band 9, 2009, S. 420–423, ISSN 1537-744X. doi:10.1100/tsw.2009.57. PMID 19484163.

[2] A. Brazma, P. Hingamp, J. Quackenbush, G. Sherlock, P. Spellman, C. Stoeckert, J. Aach, W. Ansorge, C. A. Ball, H. C. Causton, T. Gaasterland, P. Glenisson, F. C. Holstege, I. F. Kim, V. Markowitz, J. C. Matese, H. Parkinson, A. Robinson, U. Sarkans, S. Schulze-Kremer, J. Stewart, R. Taylor, J. Vilo, M. Vingron: Minimum information about a microarray experiment (MIAME)-toward standards for microarray data. In: Nature genetics. Band 29, Nummer 4, Dezember 2001, S. 365–371, ISSN 1061-4036. doi:10.1038/ng1201-365. PMID 11726920.

[3] S. Oliver: On the MIAME Standards and Central Repositories of Microarray Data. In: Comparative and functional genomics. Band 4, Nummer 1, 2003, S. 1, ISSN 1531-6912. doi:10.1002/cfg.238. PMID 18629115. PMC 2447402 (freier Volltext).

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