Der Kanton Mühlhausen war eine Verwaltungseinheit im Distrikt Heiligenstadt des Departements des Harzes im napoleonischen Königreich Westphalen. Hauptort des Kantons und Sitz des Friedensgerichts war der Ort Mühlhausen im heutigen thüringischen Unstrut-Hainich-Kreis. Die seit 1802 preußische Stadt Mühlhausen, Hauptort des Gebiets der ehemaligen Reichsstadt Mühlhausen, war der einzige Ort des Kantons neben einigen zur Stadt gehörigen Gütern und Kleinsiedlungen. Kantonmaire war Christian Gottfried Stephan.

Königreich Westphalen
Kanton Mühlhausen
Departement Departement des Harzes
Distrikt Distrikt Heiligenstadt
Hauptort des Kantons Mühlhausen
Einwohner 9288
Dörfer und Weiler 4
Städte 1
Der District Heiligenstadt mit Mühlhausen am südöstlichen Rand

Zum Kanton gehörten die Ortschaften:

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