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Benutzer:Ernsts/Kandidaten

< Benutzer:Ernsts

Meine persönliche Wunschliste (mit Priorisierung) inklusive aktueller Bearbeitungen (Vorschläge anderer Benutzer bitte auf meiner Diskussionsseite, damit ich das dann hier einphasen kann): * = neu, sonst übersetzt mit den angegebenen Quellen

V = Viren, B = Bakterien, A = Archaeen, P = Protisten inkl. Mikropilze, O = sonstige zelluläre Organismen, G = Geologie/Geographie/Ozeanologie/Limnologie inkl. Impaktkrater & Meteoriten, W = Weltraum/Astronomie, X = andere

  • V Abgleich mit NCBI. Noch offen:
    • http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/OX365879
    • Speroviridae Glazvirus inraei C158
      NCBI sagt: ENA stands for European Nucleotide Archive (also known as European Bioinformatics Institute EMBL and European Bioinformatics EBI). You just can’t have enough abbreviations 😊

https://www.ebi.ac.uk/about/contact

  • V Abgleich mit SIB ViralZone
    • dsDNA viruses, Tokiviricetes
      • Gammalipothrixvirus ist jetzt Captovirus (doppelt)
    • dsDNA viruses, Caudoviricetes
      • Magrovirales fehlt
      • Nakonvirales fehlt
      • Juravirales fehlt
      • Speroviridae mit Glazvirus fehlt
      • Fervensviridae mit Deepoceanvirus fehlt
      • Pungoviridae mit Flagovirus fehlt
      • Verdandiviridae mit Dolusvirus & Tonitrusvirus
    • dsDNA viruses, unassigned
      • Itzamnaviridae
  • V ViralZone: neue Artikel, neue Bilder
  • V Durnavirales ausarbeiten: Artikeln zu den Familien, insbes. Hypoviridae
  • G Narraburra 32 kg
    • Die Schöpfung ist noch nicht zu Ende
  • G Bear Creek 230 kg analog Narraburra
    • Die Schöpfung ist noch nicht zu Ende
  • G Forsbach bei Köln, Treysa bei Marburg, Simmern, Oesede, Breverbruch, Ramsdorf
  • A Klärung: Order "Sigynarchaeales" belongs to pyhlum Sigynarchaeaota (strain SQRJ_234) according to LPSN. This clade is not known to NCBI taxonomy. There is no relation to Lokiarchaota/Lokiarchaeia according to the rfrerenced soureces. Please could anyone fix this? Thanks.--Ernsts (talk) 07:55, 9 January 2023 (UTC)
    Might be a good idea to ping Videsh Ramsahai and throw on some magic template to archive this thing to Talk:List of Archaea genera.The closest I got for Vanwonterghem was a bunch of "Verstraetearchaeota". That's weird. "Sigynarchaeaota" is shown as sister to Lokiarchaeota in doi:10.1007/s11427-021-1969-6, one of the sources currently provided. I think someone decided that the GTDB Loki is "Lokiarchaeales", so the sister must also become an order? The assemblies are a little too new for GTDB release 214. Artoria2e5 🌉 15:48, 10 December 2023 (UTC)

Weitere Bearbeiten

Die folgenden Ideen haben geringere Relevanz oder sonstige Problemchen (polyphyletisch oder etwa „Virus oder Provirus?“), thematisch geordnet:

Archaeen Bearbeiten

Bakterien Bearbeiten

Viren Bearbeiten

  1. Partitiviridae
  2. Polymycoviridae
  3. Avsunviroidae
  4. Pospiviroidae
  5. Pararnavirae
  6. Belpauviridae
  7. Metaviridae
  8. Pseudoviridae
  9. Miaviricetes
  10. Leviviricetes
  11. Naryaviridae (CRESS) https://www.nature.com/articles/s41467-020-18474-w (Five CRESS virus families have experimentally confirmed eukaryotic hosts: Bacilladnaviridae, Circoviridae, Geminiviridae, Genomoviridae, and Nanovirid
  12. Nenyaviridae (dito)
  13. Vilyaviridae (dito)
  14. Benutzer:Ernsts/Blumeviridae es:Blumeviridae en:Blumeviridae A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy Suppl. 1, https://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/prokaryote-official/12298/download https://talk.ictvonline.org/files/ratification/m/proposals-for-ratification/11003
  15. Benutzer:Ernsts/Steitzviridae es:Steitzviridae en:Steitzviridae dito
  16. Mesyanzhinovviridae dito
  17. Casjensviridae dito
  18. Zierdtviridae dito
  19. Intestiviridae dito
  20. Steigviridae dito
  21. Suoliviridae dito
  22. Crevaviridae dito
  23. Matshushitaviridae dito
  24. Simuloviridae dito
  25. Paulinoviridae dito
  26. Tupavirus
  27. Phlebovirus
  28. Toursvirus Benutzer:Ernsts/Toursvirus
  29. Acute bee paralysis virus Akutes Bienenparalysevirus Benutzer:Ernsts/Acute bee paralysis virus en:List of diseases of the honey bee#Acute bee paralysis virus
  30. Varroa destructor iflavirus 1 Benutzer:Ernsts/Varroa destructor virus Siehe en:List of diseases of the honey bee#Deformed wing virus
  31. A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy Suppl. 1, https://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/prokaryote-official/12298/download https://talk.ictvonline.org/files/ratification/m/proposals-for-ratification/11003:(?)Mesyanzhinovviridae, (?)Kwiatkowskiviridae, Caudovirales:Schitoviridae, (?)Casjensviridae, (?)Zierdtviridae, Crassvirales:Intestiviridae, Crassvirales:Steigviridae, Crassvirales:Suoliviridae,Crassvirales:Crevaviridae, Crassvirales:Jelitoviridae, Crassvirales:Tinaiviridae, Norzivirales/Levivirales:Fiersviridae/Leviviridae, Halopanivirales:Matshushitaviridae+Simuloviridae, Timlovirales:Steitzviridae, Tubulavirales:Paulinoviridae,
  32. ebenda, sowie in: Lak megaphage Megaphages infect Prevotella and variants are widespread in gut microbiomes. Nat. Microbiol. 2019, 4, andere Megaphages/Huge Phages Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems Prevotella phage Lak megaphage
  33. Cyanophage S-2L NCBI ScienceAlert Noncanonical DNA polymerization by aminoadenine-based siphoviruses A third purine biosynthetic pathway encoded by aminoadenine-based viral DNA genomes A widespread pathway for substitution of adenine by diaminopurine in phage genomes
  34. Phage MIJ3 Frontiers CC-BY mit Photos
  35. Pseudomonas virus 42 Benutzer:Ernsts/Pseudomonas virus 42 en:Pseudomonas virus 42 Pseudomonas virus 42 Appl Environ Microbiol.: High Diversity and Novel Species of Pseudomonas aeruginosa Bacteriophages Pseudomonas virus 42 Wikispecies:Pseudomonas virus 42 Tevenvirinae
  36. Egypt bee virus Benutzer:Ernsts/Egypt bee virus Siehe en:List of diseases of the honey bee#Deformed wing virus
  37. Lake Sinai Virus 1 bis 7 Benutzer:Ernsts/Lake Sinai Virus bzw. Gattung Sinaivirus en:List of diseases of the honey bee#Lake Sinai virus Lake Sinai, USA
  38. Darwin bee virus 1 bis 8 Benutzer:Ernsts/Darwin bee virus
  39. Tulip-breaking-Virus Benutzer:Ernsts/Tulip-breaking-Virus en:Tulip breaking virus
  40. Petersilien-Y-Virus (= Unterart von Apium virus Y = Sellerie-Virus Y ???)
  41. Pleurochrysis sp. endemic virus 1a, 1b, 2, ... NCBI:Pleurochrysis endemic viruses [1] J. Martinez Martinez, I. C. Gilg, E. Lyczkowski, M. Krupovic, E. V. Koonin, W. H. Wilson:Persistent co-infection of the coccolithophorid Pleurochrysis carterae by three virus groups
  42. Salmonella virus Chi Benutzer:Ernsts/Salmonella virus Chi Siphoviridae
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  43. Enterobacteria-Phage phi80 Benutzer:Ernsts/Enterobacteria-Phage phi80 (Siphoviridae; nicht Yersinia virus Phi80-18, Autographiviridae)
  44. Bacillus-Phage Gamma Siphoviridae Gattung Wbetavirus (alias Wbetalikevirus)
  45. Bakteriophage CS112 (ΦCS112) Scharlach wie T12, RG235932681 PMC515249 PMC161974
  46. Adomaviridae Nicole L. Welch, Natalya Yutin et al.: Adomaviruses: an emerging virus family provides insights into DNA virus evolution, in: bioRxiv, 7. Juni 2018 bioRxiv: 2018/06/07/341131 (Preprint-Volltext), doi:10.1101/341131, insbes. Fig. 7, Nicole L. Welch, Michael J. Tisza et al.: Identification of “Missing Link” Families of Small DNA Tumor Viruses, in: BioRxiv; Cold Spring Harbor, 11. Juli 2019, bioRxiv: 10.1101/697771v3 (Preprint-Volltext), NCBI: Adomaviridae (family) Identification of Adomavirus Virion Proteins
  47. Clostridium botulinum phages https://oparu.uni-ulm.de/xmlui/bitstream/handle/123456789/3000/vts_8708_12945.pdf?isAllowed=y&sequence=1, https://www.researchgate.net/publication/23072048_Observations_on_bacteriophages_of_Clostridium_botulinum_type_C_isolates_from_different_sources_and_the_role_of_certain_phages_in_toxigenicity, https://viralzone.expasy.org/3967, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=12336 Clostridium botulinum phage C strain Stockholm
  48. Bakteriophagen P1 en:P1 phage P1 Artificial Chromosome
  49. Phage TSST-1 Benutzer:Ernsts/Phage TSST-1 RG235932681
  50. Aureococcus anophagefferens virus Benutzer:Ernsts/Aureococcus anophagefferens virus Brown Tide Virus Genome of brown tide virus (AaV)
    -------------------------
  51. Staphylococcus aureus phage PS42-D Enterotoxin A Ref.
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