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Demerecviridae

Familie der Ordnung Caudovirales

Demerecviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes), die Bakterien und Archaeen verschiedener Arten (Spezies) infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen genannt).[4] Der erste isolierte Phage von diesem Typ war der Coliphage T5.

Demerecviridae

Schemazeichnung eines
Virions von Escherichia-Virus T5, Tequintavirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria[2][3]
Reich: Heunggongvirae
Phylum: Uroviricota
Klasse: Caudoviricetes[1]
Ordnung: incertae sedis
Familie: Demerecviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Siphoviren)
Wissenschaftlicher Name
Demerecviridae
Links
NCBI Taxonomy: 2731690
ViralZone (Expasy, SIB): 10317
ICTV Taxon History: 201908080

Die Familie enthält drei Unterfamilien (Markadamsvirinae, Mccorquodalevirinae und Ermolyevavirinae), sowie einige Vertreter ohne Zuordnung zu einer solchen.[2]

Etymologie Bearbeiten

Die Familie wurde benannt zu Ehren von Milislav Demerec (1895–1966), einem kroatisch-amerikanischen Genetiker, der Pionierarbeit auf dem Gebiet der Bakteriophagen leistete, indem er zusammen mit dem italienisch-amerikanischen Physiker Ugo Fano (1912–2001) 1945 erstmals den Coliphagen T5 aus einer Mischung isolierte, die ihnen von Tony L. Rakieten[5] (Long Island College of Medicine, USA) zur Verfügung gestellt wurde.[4]

Beschreibung Bearbeiten

Mitglieder dieser Familie sind Caudoviren (Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur) vom Morphotyp der Siphoviren (ehemalige Familie Siphoviridae, von der die Familie durch das ICTV ausgegliedert wurde).

Ihre natürlichen Wirte sind Bakterien aus einer Reihe von Gattungen: Aeromonas, Escherichia, Klebsiella, Pectobacterium, Proteus, Providencia, Salmonella, Shigella, Vibrio und Yersinia[4] (alle Gammaproteobacteria); sowie eventuell noch einige andere der Proteobacteria (siehe §Systematik, Vorschläge).

Das dsDNA-Genom von Coliphage T5 (AY543070.1) ist 121,75 kbp (Kilobasenpaare) lang, hat einen GC-Gehalt von 39,3 mol% und kodiert 162 Proteine und 24 tRNAs (Transfer-RNAs). Es zeichnet sich durch lange (etwa 10,219 kbp oder mehr) direkte terminale Wiederholungen (englisch direct terminal repeats) aus.[4]

In der gesamten Familie reicht die Genomlänge von etwa 106,2 bis 122,8 kbp, und der GC-Gehalt variiert von 39,1 bis 45,2 mol%.[4]

Systematik Bearbeiten

Gemäß International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) gliedert sich die Familie Demerecviridae mit Stand 12. Februar 2021 wie folgt in Unterfamilien, Gattungen und Arten (von letzteren ist hier nur eine Auswahl wiedergegeben, zusammen mit einer Auswahl an Vorschlägen nach NCBI in Anführungszeichen):[3][4][6]

Familie Demerecviridae

  • Unterfamilie Ermolyevavirinae (Vibriophagen)
    • Gattung Cetovirus
      • Spezies Vibrio-Virus Ceto (englisch Vibrio virus Ceto, Typus)
      • Spezies Vibrio-Virus Thalassa (englisch Vibrio virus Thalassa)
    • Gattung Jesfedecavirus
      • Spezies Vibrio-Virus JSF10 (englisch Vibrio virus JSF10, Typus)
      • Spezies Vibrio-Virus JSF12 (englisch Vibrio virus JSF12)
      • Spezies Vibrio-Virus phi3 (englisch Vibrio virus phi3)
    • Gattung Vipunavirus (Vibriophagen)
      • Spezies Vibrio-Virus pVp1 (englisch Vibrio virus pVp1)
  • Unterfamilie Markadamsvirinae
    • Gattung Epseptimavirus (Wirte: Escherichien, Salmonellen)
      • Spezies Escherichia-Virus EPS7 (englisch Escherichia virus EPS7, Typus)
      • Spezies Salmonella-Virus 123 (englisch Salmonella virus 123)
    • Gattung Haartmanvirus (Wirte: Yersinien, nicht zu verwechseln mit der Schlangenvirus-Gattung Hartmanivirus, Familie Arenaviridae, oder der ihr zugehörigen Spezies Haartman hartmanivirus)[7]
      • Spezies Yersinia virus phiR201 (englisch Yersinia virus phiR201)
    •  
      EM-Aufnahme eines
      Virions von Escherichia-Virus T5.
       
      Modell von Lactococcus-Phage TP901-1. Basisplatte aktiv, Bindung an Poly­saccharide.
      Gattung Tequintavirus (früher T5likevirus, Wirte: Escherichien, Salmonellen, Shigellen, evtl. Epsilonproteobacteria: Campylobacter)[8]
      • Spezies Escherichia-Virus AKFV33 (englisch Escherichia virus AKFV33)
      • Spezies Escherichia-Virus BF23 (englisch Escherichia virus BF23)
      • Spezies Escherichia-Virus chee24 (englisch Escherichia virus chee24)
      • Spezies Escherichia-Virus DT5712 (englisch Escherichia virus DT5712)
      • Spezies Escherichia-Virus DT57C (englisch Escherichia virus DT57C)
      • Spezies Escherichia-Virus FFH1 (englisch Escherichia virus FFH1)
      • Spezies Escherichia-Virus Gostya9 (englisch Escherichia virus Gostya9)
      • Spezies Escherichia-Virus H8 (englisch Escherichia virus H8)
      • Spezies Escherichia-Virus mar004NP2 (englisch Escherichia virus mar004NP2)
      • Spezies Escherichia-Virus OSYSP (englisch Escherichia virus OSYSP)
      • Spezies Escherichia-Virus phiAPCEc03 (englisch Escherichia virus phiAPCEc03)
      • Spezies Escherichia-Virus phiLLS (englisch Escherichia virus phiLLS)
      • Spezies Escherichia-Virus slur09 (englisch Escherichia virus slur09)
      • Spezies Escherichia-Virus T5 (englisch Escherichia virus T5, Typus, mit Escherichia-Phage T5)
      • Spezies Salmonella-Virus NR01 (englisch Salmonella virus NR01)
      • Spezies Salmonella-Virus S131 (englisch Salmonella virus S131)
      • Spezies Salmonella-Virus Shivani (englisch Salmonella virus Shivani)
      • Spezies Salmonella-Virus SP01 (englisch Salmonella virus SP01)
      • Spezies Salmonella-Virus SP3 (englisch Salmonella virus SP3)
      • Spezies Salmonella-Virus SPC35 (englisch Salmonella virus SPC35)
      • Spezies Shigella-Virus SHSML45 (englisch Shigella virus SHSML45)
      • Spezies Shigella-Virus SSP1 (englisch Shigella virus SSP1)
      • Spezies „Campylobacter phage C8“ (englisch „Campylobacter phage C8“)
      • Spezies „Campylobacter-Phage C13“ (englisch „Campylobacter phage C13“)
      • Spezies „Salmonella-Phage 5“ (englisch „Salmonella phage 5“)
  • Unterfamilie Mccorquodalevirinae (Wirte: Pectobakterien)
    • Gattung Hongcheonvirus
      • Spezies Pectobacterium-Virus DUPPV (englisch Pectobacterium virus DUPPV, Typus)
    • Gattung Myunavirus
      • Spezies Pectobacterium-Virus My1 (englisch Pectobacterium virus My1, Typus)
  • ohne zugewiesene Unterfamilie:
    • Gattung Novosibvirus (Wirte: Proteus)
      • Spezies Proteus-Virus PM135 (englisch Proteus virus PM135, Typus)
      • Spezies Proteus-Virus Stubb (englisch Proteus virus Stubb)
      • Spezies „Proteus-Phage 1“ (englisch „Proteus phage 1“)
      • Spezies „Proteus-Phage 2“ (englisch „Proteus phage 2“)
      • Spezies „Proteus-Phage M4H10_20“ (englisch „Proteus phage M4H10_20“)
    • Gattung Pogseptimavirus (Wirte: Vibrionen)
      • Spezies Vibrio-Virus PG07 (englisch Vibrio virus PG07, Typus)
      • Spezies Vibrio-Virus VspSw1 (englisch Vibrio virus VspSw1)
      • Spezies „Vibrio-Phage ValDsh2“ (englisch „Vibrio phage ValDsh2“)
      • Spezies „Vibrio-Phage valsw3“ (englisch „Vibrio phage valsw3“)
      • Spezies „Vibrio-Phage vB_ValS_X1“ (englisch „Vibrio phage vB_ValS_X1“)
      • Spezies „Vibrio-Phage vspsw1“ (englisch „Vibrio phage vspsw1“)
    • Gattung Priunavirus
      • Spezies Priunavirus PR1 (früher Providencia virus PR1, Wirte: Morganellaceae)
    • Gattung Shenzhenvirus (Wirte: Aeromonas)
      • Spezies Aeromonas-Virus AhSzw1 (englisch Aeromonas virus AhSzw1, Typus)
      • Spezies Aeromonas virus AhSzw1 (englisch Aeromonas virus AhSzw1)
    • Gattung Sugarlandvirus (Wirte: Klebsiellen)
      • Spezies Klebsiella-Virus Sugarland (englisch Klebsiella virus Sugarland, Typus)
      • Spezies „Bacteriophage Eos“
    • ohne zugewiesene Gattung
      • Spezies „Aeromonas phage Akh-2“ (englisch „Aeromonas phage Akh-2“)
      • Spezies „Pantoea phage vB_PagS_AAS21“ (englisch „Pantoea phage vB_PagS_AAS21“, Wirte: Pantoea)
      • Spezies „Salmonella phage vB_SalS_SA001“ (englisch „Salmonella phage vB_SalS_SA001“)
      • Spezies „Serratia phage Slocum“ (englisch „Serratia phage Slocum“, Wirte: Serratia)

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV Master Species List 2021.v2. New MSL including some corrections.
  2. ↑ a b ICTV Master Species List 2019.v1. New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35).
  3. ↑ a b ICTV Master Species List 2020.v1. New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36).
  4. ↑ a b c d e f Evelien M. Adriaenssens, Mart Krupovic et al.: Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee. In: Archives of Virology, 11. März 2020, 165, S. 1253–1260; doi:10.1007/s00705-020-04577-8, uu.nl (PDF)
  5. ↑ Rakieten TL (Author). NIH PubMed.
  6. ↑ Demerecviridae (family). NCBI.
  7. ↑ Hartmanivirus (genus). NCBI.
  8. ↑ Tequintavirus. ViralZone. SIB.
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