FKS steht als Abkürzung für:
- Fachkundige Stelle im Sinne des SGB III § 84
- Fetales Kälberserum, eine in der Zellkultur eingesetzte Quelle für Wachstumsfaktoren
- Finanzkontrolle Schwarzarbeit der Bundeszollverwaltung, eine Arbeitseinheit des deutschen Zolls
- Flughafen Fukushima (IATA-Code), Verkehrsflughafen der Stadt Sukagawa in Japan
- Fluoreszenz-Korrelations-Spektroskopie, eine hochempfindliche optische Messmethode
- Forschungsinstitut für Körperkultur und Sport, Leipzig
- Freie Konferenz von StudentInnenschaften an Fachhochschulen, siehe Freier Zusammenschluss von StudentInnenschaften #Geschichte
- Fritz-Karsen-Schule in Berlin-Neukölln
