Jede Hälfte des Chorgestühls ist 13 m lang und symmetrisch aufgebaut. In der hinteren Reihe umfasst es 16 Sitze, von denen die beien westlichsten rechtwinklig, mit Blick gegen den Hochaltar, umgebogen sind. Die vordere, brüstungslose Sitzreihe umfast zehn Plätze, die asymmetrisch durch eine Treppe unterbrochen sind. Die Rückwand des Gestühls ist durch Fantasiesäulen aus figürlichen und pflanzlichen Elementen vertikal geglieder und in drei verschieden hohe Zonen mit Reliefs geschmückt. Das baldachinartig vorkragende, leicht verkröpfte Gebälk trägt eine reiche Bekrönung von vollplastischen Figuren, Waapengruppen und durchbrochenem Zierwerk. Das ganze Gestühl ist aus Eichenholz. Die Säulen bilden den künstlerisch hervorragendsten Teil des Gestühls. Sie sind als das Werk des Hauptmeisters Peter Frölicher zu erkennen. Ein ikonografisches Programm enthält diese lebensfrohe, von Sinnesfreude überquellende Säulenfolge nicht. Christliche und überwiegend antik-heidnische Figuren sin dhier zu einem typisch barocken Werk vereint.

Die Figuren der Bekrönung sind wohl Urs Füeg zuzuschreiben. Sie zeigen einen dieser Robustheit entgegengesetzen Stil von lyrischer, fast nervöser Zartheit. Die zwölf Apostel auf der Epistelseite durch Christus, auf der Evangelienseite durch Maria angeführt, sind feingliedrige Gestalten, in flatternde Gewänder mit grätigem Gefältel eingehüllt. Sie sind durchschnittlich 110 cm hoch. Die Reliefs sind in drei Zonen angeordnet. Die untersten stellen Szenen aus dem Alten Testament dar; nicht in geschichtlicher Reihenfolge, sondern so wie sie als Präfiguratioen oder Vorherbilder der darüberliegenden neutestamentlichen Szenen dienen können. Diese bilden mit ihren geohrten Rahmen die Hauptfolge. Die oberste Szenenfolge schildert vor allem Gleichnisse und Begebenheiten aus der Lehrtätigkeit Christi. Die Reihenfolge beginnt am Ostende des nörtlichen Gestühls und endet auf der gegenüberliegenden Seite des südlichen Gestühls.