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Datei:Summary of SAGE.svg

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Beschreibung

Beschreibung
English: Within the organisms, genes are transcribed and spliced (in eukaryotes) to produce mature mRNA transcripts (red). The mRNA is extracted from the organism and reverse transcriptase is used to copy the mRNA into stable ds-cDNA (blue). In SAGE, the ds-cDNA is digested by restriction enzymes (at location ‘X’ and ‘X’+11) to produce 11-nucleotide ‘digitag’ fragments. These digitags are concatenated and sequences using long-read sanger sequencing (different shades of blue indicate digitags from different genes). The sequences are deconvoluted to find the occurrence number of each digitag. Digitag can be used to report on transcription of the gene that the digitag came from is known.[1]
Datum
Quelle Eigenes Werk
Urheber Thomas Shafee
Andere Versionen

Also in series:

  • RNA Microarray
    RNA Microarray
  • RNA-Seq
    RNA-Seq
  • SAGE
    SAGE

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  1. ↑ Lowe, Rohan (2017-05-18). "Transcriptomics technologies". PLOS Computational Biology 13 (5): e1005457. DOI:10.1371/journal.pcbi.1005457. PMID 28545146. PMC: PMC5436640. ISSN 1553-7358.

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Serial analysis of gene expression Englisch

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aktuell14:21, 13. Feb. 2017Vorschaubild der Version vom 14:21, 13. Feb. 2017938 × 756 (180 KB)Evolution and evolvabilitytext as paths to avoid artefacts
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